学校始建于1956年9月，当时定名为“吉安市初级中学”。1958年正式定名为“吉安市第三中学”，校址迁至吉安市跃进路42号。文革期间，学校几经迁移、拆并。1972年9月，重新回到现址，此时，学校已发展为规模较大的完全中学。2001年，该校进一步发展为“市级重点中学”，2002年该校被定为省重点建设学校。吉安三中创建于1956年，是吉安市城南唯一的一所市级重点中学，2009年被认定为江西省重点中学。
吉安市第三中学地图学校规划占地210余亩，现有教学班58个，在校学生近三千人，教职工215人。经过多年的建设，三中已发展成为一所环境优美、设施优良、管理优质、教学优秀学校规划占地210余亩，其中校舍面积（不含教工宿舍）23000多平方米。校内林荫夹道，环境优美。学校具有教学楼、实验楼、学生公寓、食堂、图书室、语音室、微机房、多媒体教学系统，运动场等现代化教学生活设施。全校现有57个班，3000多学生。有教职工212人，（其中中，高级教理由122余人）中青年教师占75%，学历合格率达95%。
办学几十年来，该校为高、中等学院校和祖国社会主义建设培养和输送了大批合格新生和优秀人才。有过高考升学率全地区第一的辉煌，摘过高考体育专业录取人数全市第一金牌，培养了高考单科满分的姣姣者，有被清华大学录取的高才生，有从这里走出去的世界著名青年发明家、部队作曲家、全国优秀跳伞运动员等。在国家、省、地、市各类竞赛中连连获奖。仅近几年，教师在各级优课竞赛、说课比赛、教案比赛、电教课比赛中有100余人次获奖。学生在全国数、理、化知识竞赛中获全国二等奖60人次，三等奖196人次。连续四届全国中小学生电脑制作活动中，该校学生分别荣获全国一等奖2个，全国二等奖4个。中考、高考列区前茅。该校先后被评为“市级文明单位”和“省级文明单位”。97年被定为江西省高中新教材实验教学样本学校，98年被列为原吉安地区“依法治理示范学校”、吉安市“井冈之星”双文明窗口学校，2001年荣获“全国群众体育先进单位”、“中小学实验教学普及县先进学校”，2003年被为“江西省园林化单位”、“吉州区先进党总支”、“吉州区基层党组织红旗单位”等称号。